열강하마님 수표 축하해 주셔서 감사합니다.
그리고 님이 문의하신 내용의 답변을 제가 정확하게 드리기는 어렵고요
저의 생각으로는 구글 코드입력시 한글의 설정을 UTF-8로 하지 않으신 것 같습니다.
참고로 저의 코드를 보여 드리면 아래와 같습니다.

<form action="http://www.google.co.kr/cse" id="cse-search-box" target="_blank">
  <div>
    <input type="hidden" name="cx" value="partner-pub-***********" />
    <input type="hidden" name="ie" value="UTF-8" />
    <input type="text" name="q" size="10" />
    <input type="submit" name="sa" value="&#xac80;&#xc0c9;" />
  </div>
</form>
<script type="text/javascript" src="http://www.google.com/coop/cse/brand?form=cse-search-box&amp;lang=ko"></script>
</div>